С целью обеспечения охраны территории заповедника "Азас" функционирует отдел охраны заповедной территории в количестве 15 госинспекторов и оперативной группы в количестве 3 госинспекторов.
Метод охраны территории – патрульно-кордонный с усилением рейдовых проверок в критические сезоны (пожароопасный период, время рева марала, пушно-промысловый сезон охоты, время нереста рыбы и др.); постоянное дежурство на 5 кордонах, с выездом закрепленных по участкам госинспекторов и патрулированием мобильной оперативной группы. Кордоны расположены на основных тропах, ведущих в заповедник – на о. Азас, Кадыш, Маны-Холь и на устье р. Соруг.
